Dada la importancia ecológica del fitoplancton como fijador energético del ecosistema y como indicador biológico de muchas características importantes físicas y químicas del agua, se plantea inicialmente la elaboración de un atlas particular ilustrado con algunas de las entidades fitoplanctónicas de mayor ocurrencia en distintos cuerpos de agua colombianos. Algunos aspectos fitoplanctonicos se tratan de forma extensa, no porque se consideren más importantes que otros, sino porque, para desarrollar enfoques taxonómicos y ecológicos más profundos se requiere explicar una mayor cantidad de términos básicos.
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