La mayor riqueza florística está concentrada en los ecosistemas naturales, en especial los bosque, ya sean de zonas bajas o de las vertientes y laderas andinas, ecosistemas que han estado sometidos a una fuerte presión antrópica, la cual ha causado la destrucción de vastas extensiones, especialmente en las vertíentes montañosas de las cordilleras, en las planicies costeras y en los valles interandinos.