El subprograma de inversiones ambientales constituirá una cuenta dentro de FONADE, la cual será transferida al Fondo Nacional del Medio Ambiente, de conformidad con la Ley 99 de 1993. El objetivo de este subprograma es establecer un mecanismo de financiación para proyectos ambientales que generan beneficio de tipo público, que hayan surgido por iniciativa de las instancias regionales o locales y tengan un impacto significativo que justifique la financiación del Gobierno central en condiciones no reembolsables.