El objetivo del presente escrito es hacer una compilación de los indicadores biologicos de ambientes acuaticos continentales usados en Colombia dentro de un marco conceptual previo. Dichos indicadores no se han validado estadisticamente, por lo cual deben utilizarse con precaución hasta que existan estudios especificos sobre su capacidad real de bioindicación. Tambien se presentan los principales indices y sistemas bioticos utilizados en este tipo de estudios y se incluyen varios algunos conceptos sobre bioensayos, ya que esta tecnica se usa con relativa frecuencia para establecer el efecto de diversos contaminantes sobre algunas especies.