Como fuente directa e indirecta de alimento, además de muchos subproductos,incluido el estiércol, los animales son también parte de la biodiversidad y, por ello, la Granja integral autosuficiente debe incluirlos en su planeación y diseño, aunque analizando pros y contras de cada especie y, especialmente, los recursos alimenticios de que se dispone, pues el propósito del ganadero autosuficiente es ofrecerles las mejores condiciones para criarlos de acuerdo con sus necesidades y según exigencias de ética y ecología.